Il nait à Shinshu en 1864, aujourd’hui dans la Préfecture de Nagano sous le nom de Tomioka Hiderato. Son père était au service du gouverneur de Shinshu. A la mort de son père, alors qu’il n’a que 13 ans, Hiderato part pour Tokyo étudier le dessin. Assez vite il travailla comme dessinateur pour le quartier général de l’armée. En 1882, il commença à étudier avec le peintre Kobayashi Eitaku qui lui donna le nom de Eisen. Tout en continuant son travail et son apprentissage, Il commença à dessiner des kuchi-e en indépendant. A la mort d’ Eitaku, il devint un artiste indépendant à part entière et pendant dix ans il dessina des kuchi-e et des sashi-e (des illustrations de revues et de livres), en particulier pour le Myako Shimbun, un des magazines les plus connus du moment. Ses illustrations attiraient beaucoup de lecteurs qui restaient fidèle au magazine grâce aux dessins de Eisen.
Il devint plus tard le directeur artistique de la revue littéraire Shincko en 1897 et 1898.
Soucieux de rejoindre le rang des vrais artistes, il soutint l’Institut des Arts du Japon et reçu une médaille d’argent à la première exposition de l’Institut.
Personnalité très populaire et sociable, Eisen fût proche de Kogyo et de Kason. Bien qu'il se soit concentré sur la peinture au cours de ses dernières années, Eisen Tomioka est décédé avant de pouvoir se faire un nom en tant que peintre. Il mourut à l’âge de 41 ans, alors que le mouvement des kuchi-e était en plein âge d'or.
